脑脓肿相关新基因RBAG2-3的电子克隆及其功能预测

作者：胡震; 杨树源; 张建宁; 杨新宇

来源：中华神经医学杂志, 2006, (02): 113-116.

DOI：10.3760/cma.j.issn.1671-8925.2006.02.002

• 实验性脑脓肿
• 生物信息学
• 电子克隆
• 新基因

目的研究脑脓肿形成和发展过程中所涉及的新分子。方法对应用mRNA荧光差异显示技术(DD-PCR)获得的脑脓肿早期差异表达cDNA片段G2-3进行电子克隆,根据电子克隆的结果设计引物进行逆转录-多聚酶链式反应(RT-PCR)、克隆及测序,验证电子克隆的准确性,并利用生物信息学技术对电子克隆产物进行功能预测。结果G2-3经电子克隆获得长度为1157bp的新基因RBAG2-3,Genbank登陆号为CN382815。结构功能分析显示RBAG2-3编码73个氨基酸残基的蛋白,存在多个功能作用位点,并具有PSI和H-NS结构功能域。结论经电子克隆获得新基因RBAG2-3,其编码蛋白具有多个功能作用位点,并具有能对神经上皮组织基因表达起作用的结构功能域,可能在脑脓肿的发病中起重要作用。

• 单位
  天津医科大学总医院