葡萄实时荧光定量PCR稳定内参基因的筛选和验证

作者:任芳; 张尊平; 范旭东; 胡国君; 李晨; 董雅凤*
来源:分子植物育种, 2019, 17(23): 7801-7810.
DOI:10.13271/j.mpb.017.007801

摘要

选择稳定的内参基因是实时荧光定量PCR (real-time fluorescence quantitative PCR, qPCR)分析的重要条件。本研究采用不同品种、季节和组织部位葡萄样品为研究材料,利用qPCR测定了19个候选内参基因相对表达量,并采用GeNorm、NormFinder和BestKeeper等3个软件对候选内参基因表达稳定性进行分析评价。3个软件分析结果表明,表达最稳定的3个内参基因均为GAPDH、UBQ-1和EF1α-1。为验证内参基因稳定性,以筛选出的GAPDH、UBQ-1和EF1α-1为内参,对感染葡萄病毒E (Grapevine virus E, GVE)的不同部位葡萄样品中GVE相对表达量进行qPCR分析。结果表明,GAPDH、UBQ-1和EF1α-1分别单独作内参和3个基因组合作为内参进行相对定量时,GVE在植株不同部位样品中的相对表达量变化趋势基本一致,表明这3个内参基因在葡萄不同组织部位中稳定表达,适合作为葡萄qPCR分析的内参基因。

  • 单位
    中国农业科学院果树研究所