转录组测序分析细粒棘球绦虫原头蚴刺激后巨噬细胞Raw264.7 IncRNA表达的研究

作者：王正荣^*; 马勋; 张艳艳; 刘乙; 孟季蒙; 薄新文^*

来源：中国预防兽医学报, 2021, 43(07): 759-766.

• 细粒棘球绦虫
• 巨噬细胞Raw264.7
• 长链非编码RNA
• 固有免疫

为了解巨噬细胞Raw264.7在应对细粒棘球绦虫原头蚴(PSC)刺激时其长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达规律,本研究采用Illumina Hiseq 3000高通量RNA sequencing测序技术对PSC处理以及PBS处理的Raw264.7细胞进行lncRNA测序和生物信息学分析后,进一步采用GO和KEGG数据库分别对差异表达的lncRNAs进行富集分析。结果显示,和PBS对照组相比,PSC处理组有60个lncRNA分子的表达出现显著差异变化,其中17个表达上调,43个表达下调。GO分析结果显示,差异表达的lncRNA分子的靶基因主要与钠离子跨膜转运体活性调节,2型免疫反应正向调节以及自然杀伤细胞凝集素样受体结合等相关;KEGG分析结果显示,差异表达的lncRNA分子的靶基因主要参与VEGF信号、Toll样受体信号通路、NOD样受体等信号通路。本研究进一步分析了与Raw264.7细胞固有免疫相关的lncRNA分子,结果发现有11个模式识别受体(PRR)相关的lncRNA分子。随机选取6个差异表达的lncRNA分子进行了qRT-PCR验证,结果显示其表达趋势与lncRNA测序结果一致。本研究首次系统解析了巨噬细胞Raw264.7应对PSC刺激时其lncRNA的差异表达谱特性,为进一步解析lncRNA在巨噬细胞Raw264.7应对PSC刺激时的免疫调控机制奠定了基础。

• 单位
  新疆农垦科学院畜牧兽医研究所; 石河子大学; 动物科技学院