水稻两系不育系昱香S纯度鉴定的InDel标记开发

作者：农生; 崔中秋; 李军玲; 何国松; 钟森文; 王琛; 潘金炳; 孙玥; 王晓静; 闫双勇^*

来源：分子植物育种, 2023, 1-12.

• 杂交稻
• 不育系
• 纯度鉴定
• InDel标记

为了进一步深入开展新品种选育和推广，本研究对21份广西恒茂农业科技有限公司核心育种材料进行了高通量测序，总共获得二代测序原始序列1 710.4 Gb，总测序深度687.4×。通过生物信息学分析获得了不育系昱香S特异的长度大于5 bp的缺失位点32个。选择其中3个位点设计PCR引物，开发出可以用于昱香S不育系纯度鉴定的共显性标记HM15-2、HM15-4和HM15-6。实验结果显示这3个标记在不育系昱香S中显示独特的PCR扩增条带，能和公司的其他核心育种材料清晰地区分开。人工混入其他品种进行不育性纯度模拟鉴定显示：3个标记均能成功检测到混入的其他品种。因此这3个标记是进行不育系昱香S纯度鉴定的优良标记，在不育系繁种和质量控制中有重要的应用价值。

• 单位
  南宁市恒茂种业科学研究院; 广西恒茂农业科技有限公司; 天津市农业科学院