芝麻Cu/Zn超氧化物歧化酶基因的全基因组鉴定与分析

作者：张文香; 崔文宁; 高小宽; 梁魁景

来源：农业与技术, 2023, 43(20): 47-50.

DOI：10.19754/j.nyyjs.20231030011

• 芝麻
• Cu/Zn超氧化物歧化酶
• SOD
• 全基因组
• 分析

铜/锌超氧化物岐化酶(Cu/Zn-SOD)是植物体内非常重要的一种活性氧清除酶系统，本研究通过blast的方法，在芝麻全因组水平进行Cu/Zn-SOD的鉴定。结果显示，芝麻中含有4条Cu/Zn-SOD,分别命名为SiCSD1、SiCSD2、SiCSD3、SiCSD4。理化性质分析表明，4种蛋白质均为酸性蛋白质，除SiCSD3外，均为亲水蛋白。结构域分析发现，蛋白质均含有Cu/Zn-SOD特有的结构域和金属离子结合域，但都不具有跨膜结构和信号肽。亚细胞定位预测分析发现，SiCSD1-3均定位于叶绿体，SiCSD4除了叶绿体，也有可能定位于细胞质。进化树分析发现，SiCSD3与拟南芥AtCSD2聚为一支，SiCSD4与拟南芥AtCSD3聚为一支，SiCSD1和SiCSD2与烟草NpSODC、番茄SlSODC1和SlSODC2聚在一个大的分支。以上结果初步表明，SiCSD1-4具有Cu/Zn-SOD共同的理化性质，其序列的鉴定将为后续功能的研究打下基础。

• 单位
  衡水学院; 生命科学学院