基于宏病毒组测序技术的苹果病毒病鉴定与分析

作者：夏炎; 黄松; 武雪莉; 刘一琪; 王苗苗; 宋春晖; 白团辉; 宋尚伟; 庞宏光; 焦健^*; 郑先波^*

来源：园艺学报, 2022, 49(07): 1415-1428.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2021-0450

• 苹果
• 病毒病
• 宏病毒组测序技术
• RT-PCR
• 检测
• 苹果花叶病

采用宏病毒组测序技术（Virome Sequencing Technology）对河南地区染病苹果树进行病毒检测与分析，从建库测序的苹果叶片中共检测出13种病毒，其中有5种苹果病毒：苹果茎沟病毒（apple stem grooving virus,ASGV）、苹果茎痘病毒（apple stem pitting virus,ASPV）、苹果褪绿叶斑病毒（apple chlorotic leafspotvirus,ACLSV）、苹果坏死花叶病毒（applenecroticmosaicvirus,Ap NMV）和苹果绿皱缩相关病毒（apple green crinkle associated virus,AGCa V）。对病毒检测结果中的5种苹果病毒进行RT-PCR验证，扩增后均获得目的条带，与宏病毒组测序检测结果一致，表明宏病毒组测序检测结果精准可靠。根据测序结果设计特异性引物对ASPV全长进行扩增，得到1条长度为9 246 nt的ASPV-HN分离物基因组，与NCBI数据库中已报道的19个ASPV分离物的基因组核苷酸序列一致性为75.48%～79.85%；宏病毒组测序拼接所得的两条长度均为6 475 nt的ASGV基因组全长基因ASGV-HN1和ASGV-HN2，与NCBI数据库中已报道的18个ASGV分离物的基因组核苷酸序列一致性为79.98%～98.08%。对53份河南不同产区的苹果叶片样品进行苹果花叶病毒（apple mosaic virus,Ap MV）和Ap NMV的检测，结果显示花叶病症样品中均检测出Ap NMV，未检测到Ap MV，表明Ap NMV可能是引起河南地区苹果花叶病的主要病原。

• 单位
  河南农业大学园艺学院; 信阳农林学院