马铃薯StUBC12基因的生物信息学及表达特性分析

作者：付学; 唐勋; 刘维刚; 李世贵; 祁学红; 张宁; 司怀军^*

来源：农业生物技术学报, 2020, 28(05): 784-793.

• 马铃薯
• StUBC12
• 生物信息学
• 表达分析

泛素蛋白酶体途径广泛参与植物生长发育的各个阶段,其中泛素结合酶E2是该途径中酶联催化的关键酶,在底物泛素化的过程中发挥着重要的作用。本研究以马铃薯(Solanum tuberosum)栽培品种’大西洋’叶片c DNA为模板,克隆得到马铃薯泛素结合酶E2 (ubiquitin-conjugating enzyme, UBC)基因StUBC12 (GenBank No. XM006343293.2),该基因全长2 112 bp,包含3个内含子和4个外显子,编码序列(coding sequence, CDS)区长444 bp。生物信息学分析表明,StUBC12为包含148个氨基酸编码的非跨膜蛋白,具有典型的UQcon保守结构域。用qRT-PCR技术对马铃薯栽培品种’大西洋’和’青薯9号’的根、茎、叶和花进行基因表达量分析,结果表明该基因在叶和花中的表达量最高,且在’大西洋’中的表达量显著高于’青薯9号’;在干旱和盐胁迫条件下,马铃薯StUBC12基因通过上调表达提高植株的抗逆性。研究结果可为进一步研究马铃薯StUBC12基因的功能提供理论依据。

• 单位
  甘肃农业大学; 生命科学技术学院