预算绩效管理的全面实行是当前我国政府改革和发展的一个重大课题。近年来,财政部门在不断推动预算绩效管理制度改革的过程中,全面优化事业单位资金管理模式和效率,我国政府财政预算的研究已经取得了一定的进展。本文针对事业单位预算绩效管理中存在问题,如管理意识不够、绩效目标模糊、评价体系不完善、缺乏有效监督、评价成果应用不足不全面等,提出针对性的应用策略,以期为事业单位预算绩效管理工作的进一步发展提供一些参考。