引起某禽类养殖场疫情的H3N2亚型流感病毒全基因组进化分析

作者：徐春雪; 刘伟; 焦伯延; **; 刘倜; 孙林; 张钦凤^*; 王显军^*

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2018, 32(04): 367-372.

• 甲型流感
• 暴发
• 基因序列
• 抗原分析

目的了解某禽类养殖场工人间的1起流感样病例暴发疫情的流行病学特点,确定疫情性质,分析流感病毒是否存在变异或基因重组,试阐述流感病毒来源。方法采用个案调查等流行病学调查方法开展现场调查,采集所有流感样病例咽拭子标本进行核酸检测和病毒分离;对分离到的病毒进行全基因组测序,运用Edit Seq和MEGA5.05软件进行序列比对和进化分析。结果此次暴发疫情共报告流感样病例15例,罹患率为34.88%,核酸检测阳性率73.33%,分离到季节性A(H3N2)型流感病毒5株。进化分析显示分离到的H3N2流感病毒的8个基因片段均与2015—2016年流感疫苗株处于同一分支上,没有发生与禽或猪流感病毒的基因重组。5株流感病毒的血凝素(HA)有14个氨基酸位点发生了替换,其中8个位于抗原决定簇上;对神经氨酸酶基因和基质蛋白基因进行氨基酸推测分析显示,所有流感病毒均对神经氨酸酶抑制剂药物敏感,对M2离子通道抑制剂药物耐药。糖基化位点分析显示,NA新增两个糖基化位点NRT151-153、NAT245-247,其余基因未变。结论此次暴发疫情为一起季节性A(H3N2)型流感病毒暴发,病毒发生了抗原漂移,未发现与禽流感、猪流感病毒基因重组的现象。

• 单位
  济宁市疾病预防控制中心; 山东第一医科大学; 山东省疾病预防控制中心; 山东大学