水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析

作者：马银花; 刘桃梅; 万天雪; 肖新波; 胡琼; 李萍芳; 段仁燕^*; 张斌; 金晨钟; 杜波

来源：山东农业科学, 2023, 55(05): 8-14.

DOI：10.14083/j.issn.1001-4942.2023.05.002

• 水稻
• OsRLCK167基因
• 组织表达模式
• 生物信息学分析

类受体胞质激酶(receptor-like cytoplasmic kinases, RLCKs)家族是一类特殊蛋白激酶，在植物生长和病原菌防御中发挥着重要的生物学功能。在对水稻RLCKⅥ家族成员OsRRK1基因的研究中发现水稻4号染色体上存在一个与其同源性特别高的基因，即OsRLCK167(LOC＿Os04g56060)。为了丰富类受体胞质激酶家族并探究水稻胞质受体激酶基因的作用，本研究利用ExPASy-Protparam、Protscale、CD-search等在线工具和DNAMAN软件对OsRLCK167基因进行生物信息学分析；采用qRT-PCR技术对OsRLCK167基因做组织表达模式分析。结果显示：OsRLCK167蛋白的分子量为43.77776 kD,为疏水性、不稳定的酸性蛋白；对该蛋白的二级结构进行预测，显示其主要由无规则卷曲(41.94%)、α-螺旋(35.29%)、延伸链(15.35%)和β-转角(7.42%)组成；该基因在水稻不同组织均有表达，且在叶鞘中的表达量最高。结果表明，OsRLCK167基因在进化过程中具有高度的保守性，在水稻中具有功能多样性。

• 单位
  湖南人文科技学院; 杂交水稻国家重点实验室