儿童腺病毒感染基因表达谱分析及中药预测研究

作者：宋哲; 王晓; 郑佳琳; 张葆青^*

来源：中华中医药杂志, 2022, 37(09): 5425-5429.

• 腺病毒
• 差异基因
• 生物信息学
• 血根碱
• 白屈菜

目的：通过分析腺病毒（HAdV）感染儿童与健康儿童的基因表达差异，探讨感染发生发展的机制，进而预测抗HAdV的潜在中药。方法：从GEO数据库中下载GSE68004基因芯片数据，使用NetworkAnalyst在线数据库获得差异基因（DEGs），通过STRING数据库、Cytoscape 3.7.2软件及其插件进行网络拓扑分析获得核心基因，对DEGs进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。最后，利用CMap数据库及TCMSP、TCMID、ETCM数据库预测治疗儿童HAdV感染的潜在活性成分及中药。结果：共发现380个DEGs，以Degree值>平均值为原则，筛选出98个重要DEGs用作后续分析，包括92个上调基因和6个下调基因。筛选所得10个核心基因为CDC20、BUB1、CDC45、CDCA8、CCNB2、AURKA、TOP2A、KIF4A、UBE2C、BIRC5。富集分析结果表明，儿童HAdV感染DEGs主要涉及细胞周期通路及病毒感染相关通路。白屈菜是治疗儿童HAdV感染最有潜力的中药，血根碱是其抗HAdV的关键活性成分。结论：HAdV的关键致病靶点与细胞周期、有丝分裂、DNA复制、病毒在细胞内转运等过程有关。白屈菜及其所含的血根碱对于儿童HAd V感染的治疗具有很大的研究价值。

• 单位
  山东中医药大学; 山东中医药大学附属医院; 第一临床医学院