新德里金属β-内酰胺酶基因序列比对与蛋白分子结构

作者：贺松; 胡晓武; 张玲; 张德纯

来源：中国微生态学杂志, 2013, (03): 289-292.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.2013.03.004

• 新德里金属β-内酰胺酶
• 同源性
• 序列比对 New Delhi metallo-β-lactamase
• Homology
• Sequence alignment

目的分析不同来源细菌新德里金属β-内酰胺酶(NDM)编码基因序列的相似性和同源性,并分析其蛋白分子结构。方法在GenBank中检索目前已经注册的NDM编码基因序列88个(包括NDM-1～NDM-6),利用ClustalW2生物软件在线分析NDM基因序列的相似性和同源性,建立基因进化树,分析编码基因序列的特点;利用ESyPred3D软件构建三维结构图,并用Molsoft ICM-Pro软件进行编辑处理。结果 88个NDM编码基因是完全一致的长度为813 bp的基因序列,具有很高的同源性;NDM蛋白由270个氨基酸组成并借助Zn2+和枸橼酸维持其分子空间结构。结论 NDM编码基因具有很高的同源性,...

• 单位
  重庆医科大学