艾伯特埃希菌PFGE分子分型及其数据库的建立

作者：刘祥; 张玲; 闫国栋; 张正东; 王红; 李群

来源：中国卫生检验杂志, 2018, 28(03): 268-282.

• 艾伯特埃希菌
• 脉冲场凝胶电泳
• 分子分型数据库
• 溯源

目的建立艾伯特埃希菌PFGE分子分型方法,分析不同来源艾伯特埃希菌间的同源关系,并建立其PFGE分型数据库。方法参考非O157大肠埃希菌PFGE分型方法,对从自贡、泸县地区分离的63株艾伯特埃希菌和1株艾伯特埃希菌参考菌株LMG20976进行PFGE分析,利用Bio Numerics 7.5软件分析PFGE图谱并建立数据库,并对分型结果与样本来源、类型、ST型、intimin亚型等进行关联性分析。结果 64株艾伯特埃希菌分型效果明显,被分为46种PFGE带型,分别命名为EASX01001EASX01046,相似度为55%100%,包含9种克隆群(≥2种带型形成克隆群),同种带型超过2株的带型共有8种。结论非O157大肠埃希菌PFGE分型方法适用于艾伯特埃希菌分型研究,比MLST技术具有更高的分辨能力,通过图谱分析发现艾伯特埃希菌具有遗传多样性的特点。同时,建立的数据库为深入了解艾伯特埃希菌的分子流行病学特征提供科学依据。