荧光PCR熔解曲线法快速鉴定痰标本中分枝杆菌菌种的临床应用价值

作者：陈新朝; 陈晓红; 许榕青; 黄明翔^*

来源：深圳中西医结合杂志, 2023, 33(08): 54-57.

DOI：10.16458/j.cnki.1007-0893.2023.08.017

• 非结核分枝杆菌
• 聚合酶链式反应
• 熔解曲线法

目的：研究荧光聚合酶链式反应（PCR）熔解曲线法快速鉴定痰标本中分枝杆菌菌种的临床应用价值。方法：采集福州肺科医院2018年1月至2019年12月经BACTEC MGIT 960系统液体培养阳性的558株疑似非结核分枝杆菌（NTM）临床分离菌株。对所有菌株均开展荧光PCR熔解曲线及16S核糖体核糖核酸（rRNA）基因测序法鉴定。将16S rRNA基因测序结果作为标准，采用荧光PCR熔解曲线法鉴定NTM的效能，分析主要NTM的耐药性情况。结果：16S rRNA基因测序法鉴定结果显示，疑似NTM菌种以胞内分枝杆菌（M.胞内）、龟/脓肿分枝杆菌（M.龟/脓肿）、鸟分枝杆菌（M.鸟）、堪萨斯分枝杆菌（M.堪萨斯）及戈登分枝杆菌（M.戈登）为主；荧光PCR熔解曲线法鉴定结果显示，疑似NTM菌种亦以上述5种为主。荧光PCR熔解曲线法鉴定M.龟/脓肿的灵敏度、特异度及准确度为95.7%、100.0%、99.1%;M.胞内的灵敏度、特异度及准确度为100.0%、97.3%、98.7%;M.鸟灵敏度、特异度及准确度为88.7%、100.0%、98.6%；其他NTM菌种的灵敏度、特异度及准确度均为100.0%。一致性分析结果显示：荧光PCR熔解曲线法与基因测序法鉴定各种NTM菌种的一致性在0.81～1.00之间。16S rRNA基因测序法与荧光PCR熔解曲线法鉴定结果不一致菌株共13株，包括5株M.龟/脓肿及8株M.鸟。结论：荧光PCR熔解曲线法快速鉴定痰标本中NTM菌种的效能较佳，与基因测序法存在较高的一致性。