足月儿与早产儿脐血有核红细胞基因组DNA甲基化差异分析

作者：杨楠楠; 罗振元; 周曼; 林虹; 王薇; 黄盛文^*

来源：中国实验血液学杂志, 2020, 28(03): 942-947.

DOI：10.19746/j.cnki.issn1009-2137.2020.03.037

• 甲基化芯片
• γ珠蛋白基因
• 甲基化位点
• 脐血
• 有核红细胞

目的:采用甲基化基因芯片技术从全基因组水平分析足月儿与早产儿脐血有核红细胞DAN甲基化差异,筛选出可能与γ珠蛋白基因(HBG)表达相关的差异甲基化基因及生物信号通路。方法:收集足月产儿及早产儿各8例,取其脐血标本,分离脐血有核红细胞并提取基因组DNA,并对其进行亚硫酸氢盐转化。利用Illumina 850K甲基化芯片检测2组样本的DNA甲基化位点。筛选差异甲基化位点,并通过GO和KEGG富集分析得到差异甲基化基因的功能。结果:相较于早产组,足月组共筛选到4 749个差异甲基化位点,其中低甲基化位点4 359个,高甲基化位点390个。GO和KEGG分析结果显示,差异甲基化基因的功能主要涉及造血系统、生长发育过程、Wnt和Notch信号通路等。结论:本研究获得了足月组和早产组脐血有核红细胞在全基因组水平的差异甲基化位点,筛选出可能与γ→β珠蛋白基因表达转换相关的通路和基因。这为后续进一步研究HBG基因的表达调控机制提供了新的研究靶点。

• 单位
  贵州省人民医院; 贵阳市妇幼保健院; 贵阳市第二人民医院