意大利蜜蜂甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因amGAPDH2的cDNA克隆与序列分析

作者：欧阳霞辉; 徐文凯^*; 刘丽霞; 臧荣鑫; 罗前; 罗鹏辉

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(02): 568-574.

DOI：10.13417/j.gab.039.000568

• 意大利蜜蜂
• 甘油醛-3-磷酸脱氢酶
• 基因克隆

应用RT-PCR技术克隆了意大利蜜蜂(Apis mellifera)甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因amGAPDH2,利用MEGA5.1、DNAMAN、PredictProtein和I-TASSER等软件对该基因进化关系以及其所对应的蛋白的同源性、理化性质和结构进行了预测和分析。从意大利蜜蜂cDNA文库中克隆得到了长1 188 bp的amGAPDH2序列,GenBank登录号为MH152402。该序列具有完整的开放阅读框(ORF, 114～1 115 bp),其编码333个氨基酸。该基因编码的氨基酸序列与其它昆虫的GAPDH有较高的序列相似性(80%以上),系统进化分析表明amGAPDH2与中华蜜蜂、小蜜蜂的序列相似性最高。利用ProtParam等软件对amGAPDH2编码的蛋白质分析结果显示,amGAPDH2属于不稳定、亲水性蛋白;二级结构属于混合型,Helix占25.53%、Strand占24.62%、Loop占49.85%;am GAPDH2具有两个保守结构域:一个是N端的NAD (P)结合结构域,另一个是C端的催化结构域GpdhC。该研究为后期amGAPDH2基因的生理功能研究提供了理论依据。

• 单位
  西北民族大学