杭州地区2015年麻疹病毒核蛋白的基因特征

作者：宋闻; 陈海哨; 祁正红; 赵仕勇^*

来源：国际流行病学传染病学杂志, 2018, 45(06).

• 麻疹病毒
• 核蛋白
• 基因型
• 序列分析
• H1a亚型

目的了解2015年杭州地区麻疹病毒(MV)流行株的核蛋白基因特征。方法收集2015年在杭州市儿童医院(麻疹定点收治医院)住院麻疹患儿中分离得到MV株共18株,用RT-PCR检测并对部分PCR扩增阳性的片段进行基因测序,绘制系统进化树进行同源性分析。结果 18株MV经基因测序及系统进化树分析后均为H1a亚型,与该型参考株China93-2、China93-4核苷酸同源性为98.65%～98.88%;与GenBank登记的Jiangxi.CHN/23.11的MV株核苷酸同源性高达99.55%～99.78%,具有高度同源性,属于同一分支。遗传距离分析表明:2015年分离株组内遗传距离最小,为0.000,2015年分离株和H1a型之间的组间遗传距离最小,为0.013,而2015年分离株、H1a型与A型的组间遗传距离均较大,分别为0.081及0.083。结论 2015年杭州及周边地区儿童MV野毒株的优势亚型为H1a亚型,且为同一传播链,未发现疫苗株及其他型别。