刺槐Genomic-SSR与EST-SSR遗传差异性分析

作者：董黎; 张江涛; 文彦忠; 牛东升; 田书勇; 孙宇涵; 李云^*

来源：中国农学通报, 2019, 35(19): 49-57.

• 刺槐
• Genomic-SSR
• EST-SSR
• 遗传相似系数
• 遗传差异性

为在刺槐育种研究中合理选用不同来源的SSR分子标记,选取12个刺槐个体,试剂盒提取DNA后分别利用9对Genomic-SSR引物和9对EST-SSR引物进行扩增,并采取毛细管电泳检测扩增产物。利用所得条带信息及相关软件对2种SSR分子标记进行多态性、遗传相似系数相关性以及聚类等方面的比较分析。结果显示,刺槐Genomic-SSR平均检测到的条带数为6、Shannon多样性指数为1.3833、观测杂合度为0.5749、期望杂合度为0.6832;EST-SSR平均检测到的条带数为5.1、Shannon多样性指数为1.2711、观测杂合度为0.5648、期望杂合度为0.6526。由Genomic-SSR计算得到的个体间的遗传相似系数以及聚类结果与2种SSR标记综合计算得到的遗传相似系数和聚类结果更为相似。结果表明,刺槐Genomic-SSR与EST-SSR存在一定的遗传差异性,但差异并不显著;刺槐Genomic-SSR能更加准确地揭示基因型之间的遗传关系;刺槐EST-SSR具有相对较强的保守性。

• 单位
  北京林业大学; 河南省林业科学研究院