基于COI基因分析的植物病原性轮枝菌条形码评价

作者：段维军; 郭立新; 顾建锋; 张慧丽; 张祥林; 夏侯阳; 陈先锋

来源：植物检疫, 2013, (06): 41-45.

DOI：10.19662/j.cnki.issn1005-2755.2013.06.007

• 轮枝菌
• 细胞色素c氧化酶亚基I
• DNA条形码
• 邻接树 Verticillium sp.
• COI
• DNA barcoding
• phylogeny tree

数以百万计的真菌种类对真菌识别构成了巨大的挑战。本研究以轮枝菌属中的重要植物病原性轮枝菌及其近似种共13种34个菌株为材料,探讨COI基因作为该属DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段不存在内含子,PCR扩增与测序成功率较高,但部分测试菌种的COI基因存在种内差异大于种间差异的情况,种间和种内距离存在交叉重叠,序列鉴定成功率为73.5%,难以达到便捷、准确鉴定植物病原性轮枝菌种类的目的。因此,COI基因不宜作为植物病原性轮枝菌的DNA条形码。

• 单位
  宁波出入境检验检疫局; 新疆出入境检验检疫局; 宁波大学