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摘要
沼泽型水牛的主要经济性状是役用，而河流型水牛的主要经济性状是乳用。宿主生产形状的差异常伴随着其肠道微生物群落的变化。本文对成年河流型和沼泽型水牛肠道菌群进行宏基因组比较研究，研究结果表明：沼泽型水牛组样品共获得2 192 526个非冗余基因，河流型水牛组样品获得1 686 914个非冗余基因，两组共有420 452个非冗余基因重叠，由此可见两种水牛肠道特有的基因数量远大于共有的基因数量，在肠道微生物基因组成上差别较大。放线菌门(Actinobacteria)在沼泽型水牛肠道中的相对丰度显著高于河流型水牛的，放线菌门是土壤中主要的细菌，推测沼泽型水牛在野外稻田役用过程中因采食鲜草与土壤密切接触而获得放线菌门。在属水平发现河流型水牛肠道中的罗氏菌属(Roseburia)和Turicibacter相对丰度高于沼泽型水牛的，其产生丁酸和乳酸为合成肉、奶提供了前体物质，推测与河流型水牛生长速度快、产奶量高性状相关。在种水平发现，沼泽型水牛肠道中发现了与免疫力相关的假长双歧杆菌(Bifidobacterium＿pseudolongum),河流型水牛肠道中发现与脂质代谢相关的Turicibacter＿sanguinis。进一步分析发现KEGG代谢通路网络图也显示河流型水牛肠道微生物组在脂代谢通路比沼泽型水牛的更活跃，推测与水牛乳脂含量高有关。在COG功能基因相对丰度分析中发现，沼泽型水牛肠道菌群的防御机制(defense mechanisms)功能基因相对丰度高于河流型水牛的，说明沼泽型水牛的抗逆性较强。本研究初步阐明了不同类型水牛的肠道微生物丰度和功能的异同，为阐明肠道菌群结构对水牛生产性状的调控机制奠定了基础，亦为通过调控水牛肠道微生物群落改良水牛的经济性状提供了重要参考。
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