CENPA基因在不同鸡种上的序列比较分析

作者：郑圣晗; 陈颖; 陈国宏; 常国斌^*

来源：上海农业学报, 2019, 35(04): 75-79.

DOI：10.15955/j.issn1000-3924.2019.04.13

• 鸡
• CENPA基因
• SNPs
• InDel
• 进化树

为找出不同鸡种CENPA基因序列上的差异,为鸡抗病育种研究提供基础材料,利用目标区域捕获测序技术对25个鸡种的CENPA基因进行序列测定。以NCBI网站上Gallusgallus-5. 0(GCF000002 315. 4)的CENPA基因序列为参照,利用MEGA 6. 06软件对25个鸡种的基因序列进行比对分析,统计SNPs位点和InDel位点,并构建系统进化树。结果表明:CENPA的外显子没有丰富的多态性,CENPA内含子的丰富多态性主要体现在Intron4上。CENPA基因在Exon3具有保守性,在鸡的进化历史中稳定遗传。25个鸡种大致可被分为4大类,表明我国的地方鸡品种资源丰富,且之间的同源性较低,可为抗病育种的研究提供丰富的样本。

• 单位
  扬州大学