基于转录组测序的长吻鮠转录组分析

作者：徐慧敏; 巨丹丹; 龚兵; 肖明松^*

来源：安徽科技学院学报, 2022, 36(05): 42-48.

DOI：10.19608/j.cnki.1673-8772.2022.0036

• 长吻鮠
• 转录组测序
• 序列分析

目的:长吻鮠是我国特有的淡水名贵经济鱼类，通过转录组测序技术发掘其功能基因，提高其优良性状。方法:采用Illumina测序平台对长吻鮠肌肉组织进行转录组测序。结果:利用Trinity软件对所得clean data进行从头组装，共得到44 153条unigene,序列长度为201～44 153 bp,平均长度为1 394 bp。Unigene功能注释显示，NR注释率为53.75%,Pfam注释率为34.46%,KEGG注释率为28.59%,String注释率为27.98%,Swiss-Prot注释率为37.82%,其中有23 731条序列在NR数据库中得到注释。将获得的12 939条Unigene与GO数据库进行分析，可划分为细胞组分、分子功能和生物学过程3个大类；在KEGG数据库中则注释到5大类34小类中，有机过程中的功能预测的较多，有4 562条。结论:本研究成果丰富了长吻鮠的基因遗传资源，可为长吻鮠生物学研究提供基础数据。

• 单位
  安徽科技学院; 动物科学学院