应用数据包络分析方法分析我国16所林业高校及30所农业高校科研效率。结果发现,农林类高校间的科研效率存在一定的差异,但整体水平呈上升趋势;农林类"985/211工程"高校的科研投入产出效率水平整体低于普通高等学校,资源配置机制有待完善;我国农业类与林业类高校的科研效率在2012—2016年都呈现出较大的波动趋势。最后,提出完善农林高校科研资源配置效率的对策建议。