口蹄疫病毒株AF72 VP3的结构模拟与分析

作者：陈启伟; 王永录; 张永光; 潘丽; 方玉珍; 蒋守田; 吕建亮; 周鹏; 张中旺; 张昱; 张淑刚; 杜进鑫; 李正丰; 王刚

来源：微生物学通报, 2009, (11): 1716-1722.

DOI：10.13344/j.microbiol.china.2009.11.026

• 口蹄疫病毒
• VP3结构蛋白
• 3D结构
• B细胞表位 FMDV
• VP3 structure protein
• 3D model
• B-cell epitope

以口蹄疫病毒株AF72 RNA为模板,反转录并扩增目的基因,PCR纯化产物与pGEM T-Easy载体连接并转化JM109菌株,用凝胶电泳、PCR和SpeⅠ/SphⅠ双酶切法鉴定为阳性的重组质粒进行测序。比对测序结果确定AF72 VP3的核苷酸序列,利用同源建模的方法建立AF72 VP3结构蛋白的3D结构,在此基础上,综合亲水性、可塑性、抗原指数以及表面可能性等参数预测AF72 VP3结构蛋白的B细胞抗原表位。分析表明,口蹄疫病毒VP1、VP2、VP3和VP4在核苷酸水平上的变异率是无差异的(P>0.05);而它们在氨基酸水平上的变异率差异显著(P<0.05)。该毒株与20株源于GenBank...

• 单位
  农业部; 家畜疫病病原生物学国家重点实验室; 中国农业科学院兰州兽医研究所; 甘肃农业大学