肾素与抑制性地肤子皂苷相互作用的分子机制（英文）

作者：光翠娥; 张海玲; 汪俊卿; Robert PHILLIPS

来源：食品科学, 2017, 38(09): 8-13.

• 肾素
• 皂苷
• 分子对接
• 分子动力学模拟
• 分子力学泊松-波尔兹曼表面积

地肤子中的木鳖子皂苷Ic和2’-O-β-D-吡喃葡萄糖木鳖子皂苷Ic有较强抑制肾素体外活性的功能。分子对接证实两皂苷与肾素结合较好,分别形成9个和4个氢键,氨基酸Ser230与Tyr231是氢键作用的关键残基,而Ala229、Met303、His301、Asp38、Arg82、Tyr83与Ile137则对疏水结合起重要作用。分子动力学模拟约1 000 ps后,两复合物平衡,均方根偏差分别为0.224 nm和0.219 nm,两皂苷降低了肾素链开始约160个氨基酸的均方根波动。分子力学泊松-波尔兹曼表面积法获得的结合自由能分别为-44.36 kcal/mol与-62.46 kcal/mol,其中主要驱动力是静电和范德华作用,而极性溶剂化能则强烈阻碍结合。3种方法综合揭示了两种地肤子皂苷抑制肾素的分子机制。

• 单位
  食品科学与技术国家重点实验室; 江南大学; 生物工程学院