玉米CCCH基因家族鉴定及分析

作者：郭栋; 宋雅菲; 张佳阔; 袁慧敏; 杜媚; 刘颖慧^*; 袁卉馥^*

来源：中国农业科技导报, 2019, 21(08): 19-27.

DOI：10.13304/j.nykjdb.2018.0541

• 玉米
• CCCH基因
• 蛋白结构

CCCH锌指蛋白与植物生物和非生物胁迫、生长发育及抗病性密切相关。以玉米为材料,应用在线工具与公共数据库,共鉴定出63个CCCH基因,命名为Zm CCCHs,进一步对玉米与水稻、拟南芥、小立碗藓的CCCH基因进行生物信息学分析。结果表明:玉米的CCCH家族基因在染色体上呈不均匀分布,蛋白质氨基酸序列长度在110～962 aa之间。Zm CCCHs基因具有相对保守的结构,即包含CCCH结构域、WD40结构域、C2H2结构域、C3HC4结构域,CCCH蛋白结构中含有2个α螺旋和4个β折叠结构域。进化树分析表明玉米CCCH蛋白与水稻CCCH蛋白序列具有较高的同源性。上述结果为深入研究该基因家族的功能与表达调控提供了参考信息。

• 单位
  河北北方学院