摘要
目的 探讨铜死亡相关基因(CRGs)在甲状腺乳头状癌(PTC)组织中的表达,并探索其在PTC预后中的潜在价值。方法 UCSC数据库下载来源于癌症基因组图谱数据库(TCGA)中TCGA-THCA数据集的转录组数据及对应临床信息,并结合TCGA泛癌临床资料数据集的随访信息。通过基因差异性分析和Cox回归分析筛选出与PTC疾病无进展生存期(PFS)相关的CRGs。采用Wilcoxon秩和检验分析该基因在PTC组织和癌旁组织之间的差异表达和该基因与临床特征的关系,进一步使用Cox回归分析该基因与PTC患者PFS的相关性。最后对该基因进行基因集富集分析(GSEA)。结果 本研究从UCSC数据库筛选纳入PTC患者424例。最终识别出在PTC中2个上调的CRGs基因(赖氨酰氧化酶样蛋白和周期蛋白依赖激酶抑制因子2A基因)和3个下调的CRGs基因[铜蓝蛋白、血管内皮生长因子A和铁氧还蛋白1 (FDX1)基因]。Cox单因素分析筛选出与PFS相关的1个CRGs基因FDX1。FDX1在PTC组织中显著低表达(P<0.001),表达水平与伴有腺体外侵犯(P<0.001)、较高的T分期(P<0.001)和有淋巴结转移(P<0.001)有关。FDX1与PTC患者的预后呈正相关(P<0.001),FDX1低表达组有更高的疾病进展风险。Cox回归分析显示,FDX1是PTC患者PFS的独立预后指标(P=0.002)。GSEA结果显示在低表达表型中,P53途径和DNA复制均呈差异富集。结论 FDX1是与PTC患者PFS相关的CRGs,与PTC预后密切相关,为该肿瘤的治疗和预后监测提供了新的方向和证据。
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