牦牛RPLP1基因克隆、生物信息学分析及组织表达规律分析

作者：张振宇; 王兴东; 叶娜; 姚喜喜; 梁春年; 阎萍; 潘和平^*

来源：基因组学与应用生物学, 2021, Z3: 3012-3018.

DOI：10.13417/j.gab.040.003012

• 牦牛
• RPLP1基因
• 克隆
• 组织表达

为研究牦牛酸性核糖体磷酸蛋白P1 (RPLP1)基因结构与功能以及其在各个组织间的表达规律，本研究采用同源克隆和RT-PCR方法扩增牦牛RPLP1基因并获得全长序列，并对牦牛RPLP1的蛋白质结构和氨基酸序列进行生物信息学分析，然后提取青海大通牦牛心脏、肝脏、肺脏、脾脏、肾脏以及肌肉组织总RNA，利用RT-qPCR技术检测RPLP1基因在不同组织中的相对表达情况。RPLP1基因开放阅读框长度为345 bp，编码114个氨基酸，理论相对分子质量为28.4 kD，等电点pI值为5.75,RPLP1蛋白的理化性质稳定，整条肽链呈疏水性，无信号肽，无跨膜区，主要在核糖体中发挥作用，该蛋白质二级结构主要由α螺旋(51.75%)、延伸链(9.65%)、无规卷曲(35.09%)组成；同源性比对结果显示，牦牛与普通牛亲缘关系最近；RT-qPCR结果显示，RPLP1基因在牦牛的7个组织中都参与表达，其在肌肉组织中的相对表达极显著高于其他组织(P<0.01)。本研究为后期牦牛RPLP1基因的功能研究奠定了基础。

• 单位
  西北民族大学; 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所