人参PgPP2C2基因的克隆及生物信息学分析

作者：梁浩; 张亚玉^*; 孙海; 李美佳; 张正海; 邵财; 王莹

来源：分子植物育种, 2023, 21(16): 5221-5230.

DOI：10.13271/j.mpb.021.005221

• 人参(Panax ginseng)
• PP2C2基因
• 生物信息学分析

2C型蛋白磷酸酶(PP2C)是最大的蛋白磷酸酶家族，PP2C蛋白在响应不同非生物胁迫中发挥着重要作用。为了探究人参Pg PP2C2基因的功能，基于实验室前期转录组数据库，从人参中克隆了一个2C型蛋白磷酸酶基因，命名为Pg PP2C2，并对Pg PP2C2基因的序列、编码蛋白质的结构进行分析，预测了其功能。研究结果表明，该核苷酸序列的开放阅读框为1 269 bp，编码422个氨基酸。其编码蛋白质属于亲水性蛋白，无信号肽，未形成跨膜结构域，包含2C家族丝氨酸/苏氨酸磷酸酶催化结构域。通过蛋白互作分析，发现Pg PP2C2蛋白与HOG1 (参与渗透调节的丝裂原活化蛋白激酶)和NBP2 (NAP1-binding蛋白2,参与HOG途径的蛋白)的互作分数分别高达0.996和0.984，推测Pg PP2C2蛋白可能参与渗透胁迫调节及磷酸化过程。本研究结果可为后期进一步研究PgPP2C2基因的功能和开展人参种植调控提供理论基础。

• 单位
  中国农业科学院特产研究所; 生物工程学院; 成都大学