基于生物信息学验证CCR5参与类风湿关节炎发生发展的遗传学和组织学证据全文替换

作者：王友强; 兰由玉^*; 李世勇

来源：西南医科大学学报, 2021, 44(01): 16-21.

• 类风湿关节炎
• CCR5
• 生物信息学

目的:通过生物信息学和实验方法探寻CC趋化因子受体5(CCR5)在类风湿关节炎(RA)的表达情况,以此验证CCR5参与RA发生发展的遗传学和组织学证据,并为后续利用RA大鼠模型研究CCR5的作用机制奠定基础。方法:在Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中以"rheumatoid arthritis"为关键词检索RA的基因芯片GSE 97779、GSE 77298、GSE 10500、GSE 55457和GSE 1919,利用生物信息学分析工具GEO2R和limma包筛选差异基因以了解CCR5的表达情况,再通过免疫组化、qRT-PCR和Western Blot验证CCR5在RA大鼠中的异常表达情况。结果:在GSE 1919、GSE 97779、GSE 77298、GSE10500、GSE 55457芯片中,CCR5在RA患者呈异常高表达,且CCR5是唯一在5个芯片均差异表达的基因。给大鼠注射弗氏完全佐剂10 d后,RA组大鼠关节炎指数(AI)明显升高,且随时间增加逐渐上升,至25 d时AI(7.12±1.13)较10 d(1.21±0.73)、15 d(4.87±1.21)时进一步增高(P <0.05);HE染色提示,RA组滑膜组织有较多炎性细胞浸润,可见新生血管形成,由此可见RA大鼠模型构建成功。免疫组化、q RT-PCR和Western Blot均提示RA组滑膜组织CCR5的表达水平较control组明显升高,与生信分析结果一致。结论:CCR5在RA患者及RA大鼠中均呈高表达,利用生物信息学和实验方法验证CCR5参与RA发生发展的遗传学和组织学证据是可行的,也为后续利用RA大鼠模型研究CCR5的具体作用机制奠定了理论基础。

• 单位
  西南医科大学