摘要
IDD (INDETERMINATE DOMAIN)蛋白是一种特殊的植物转录因子,它广泛地参与植物的生长和逆境反应,然而IDD基因家族在葡萄中仍缺乏系统鉴定。本研究从公布的葡萄基因组数据库中,筛选出6个VvIDD基因,并用生物信息学技术对其基因的染色体定位、理化性质、结构功能、系统发育、表达特性等方面进行分析。结果表明:鉴定到分布在葡萄4条染色体上的6个VvIDD家族基因,并命名为VvIDD1~VvIDD6。所有IDD蛋白均是亲水性的蛋白,没有跨膜结构和信号肽,在蛋白质的二级结构中α-螺旋和无规则卷曲含量最多,三级结构既存在保守性又存在差异性。系统发育分析发现在VvIDD基因序列3’端均包含一个较长的外显子。通过构建拟南芥、水稻、苹果和葡萄系统发育树,IDD基因家族成员可被划分为6个群体。顺式作用元件分析结果显示,VvIDD基因的上游启动子序列中含有大量光响应元件和激素响应元件,推测其与植物生长发育存在着一定的联系。通过对VvIDD基因的特异表达研究,发现大多数VvIDD基因在花后2周和10周时期的表达水平较高,推测IDD基因可能在葡萄生长期、转色期起重要作用。本研究为深入了解葡萄VvIDD基因家族的结构和功能提供理论依据。
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