吉林省2009-2011年柯萨奇病毒A组16型基因亲缘关系研究

作者：周剑惠; 王爽; 屈昊; 魏雷雷; 张勇; 曹凤瑞; 程涛; 田鑫; 单元春; 李大强; 吕淑梅; 林琳; 付思美; 范明

来源：中华实验和临床病毒学杂志, 2014, 28(04): 249-251.

• 柯萨奇病毒感染
• 基因

目的分析致吉林省2009-2011年手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)流行的柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus group Atype 16,CA16)分离株的基因亲缘关系。方法对吉林省2009-2011年分离获得的54株CA16分离株的VP1编码区基因进行逆转录-聚合酶链反应扩增以及基因序列测定,使用MEGA 4.0软件进行基因亲缘关系分析。结果吉林省2009-2011年54株CA16分离株有28株属于B1a基因亚型,26株属于B1b基因亚型;2009-2011年每年B1a基因亚型所占比例分别为86.7%、47.1%、31.8%,B1b基因亚型所占比例分别为13.3%、52.9%、68.2%。28株B1a基因亚型CA16形成了一个优势传播链和一个小传播链,26株B1b基因亚型CA16形成了一个优势传播链和两个小传播链。结论 B1a基因亚型所占比例呈现逐年下降趋势,B1b基因亚型所占比例呈现逐年增加趋势。吉林省2009-2011年呈现两个基因亚型各有一个优势传播链为主、各有12个小传播链为辅的共流行传播模式。

• 单位
  吉林省疾病预防控制中心; 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所; 吉林大学