绵羊miRNA-1185-5p的基因组定位、靶基因预测和功能分析

作者：范文斌; 祁云霞; 刘永斌^*

来源：畜牧与饲料科学, 2020, 41(02): 20-23.

• miRNA-1185-5p
• 靶基因
• GO功能注释
• 绵羊

miRNAs是一类小分子非编码RNAs,在机体许多生理及病理过程中发挥调控作用。该课题组前期研究发现,miRNA-1185-5p在经产双羔母羊卵巢中表达水平显著低于经产单羔母羊。为进一步深入挖掘miRNA-1185-5p在绵羊生殖过程中的作用,利用生物信息学手段分析了miRNA-1185-5p的基因组定位,预测其靶基因,并对靶基因进行GO功能分析。结果表明,miRNA-1185-5p是位于绵羊18号染色体的内含子miRNA;利用miRDB和microT 2种方法预测获得miRNA-1185-5p的23个靶基因,这些靶基因主要参与细胞增殖、分化和凋亡过程以及代谢等生物学过程,其中,靶基因AhR直接参与生殖过程。该研究说明miRNA-1185-5p可能通过作用于AhR等靶基因对绵羊生殖过程发挥调控作用。

• 单位
  内蒙古自治区农牧业科学院; 呼和浩特职业学院