梅花花色合成基因的qPCR内参基因筛选及验证

作者:叶勇; Henry Lusekelo INGWE; 郑子飞; 陈樱之; 赵宏波; 董彬*
来源:农业生物技术学报, 2023, 31(12): 2674-2684.

摘要

梅花(Prunus mume)是中国十大传统名花之一,园林应用广泛。随着梅花分子生物学研究的不断深入,筛选出适用于梅花花色合成基因qPCR分析的内参基因至关重要。本研究选择3个不同色系的共计6个梅花栽培品种,进行花色表型分析和花青素含量测定,发现花青素含量与梅花花瓣的颜色呈正相关。同时,利用qPCR技术,在梅花不同色系品种间对14个候选内参基因的表达进行检测,使用3种软件geNorm、NormFinder、BestKeeper和ΔCt方法进行表达稳定性分析,最后用RefFinder程序综合分析,得出最佳内参基因,并利用花青素合成相关基因进行验证。实验结果表明,3-磷酸甘油醛脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, GAPDH)和肌动蛋白1(actin 1, ACT1)表达最为稳定,ACT3表达最不稳定。验证结果表明,以GAPDH和ACT1为内参基因时,花青素合成相关基因的表达模式相近,较多基因呈现显著的差异表达;当以ACT3作为内参基因时,花青素合成相关基因的表达模式与GAPDH和ACT1为内参基因的结果不同,而且只有少数基因呈现显著的差异表达。本研究为深入开展梅花花色合成相关基因的表达模式分析提供基础资料。