基于丹参基因组的蛋白磷酸酶2C家族的系统分析

作者：徐志超; 浦香东; 宋经元

来源：中国现代中药, 2018, 20(06): 652-657.

DOI：10.13313/j.issn.1673-4890.20180312001

• 丹参
• 蛋白磷酸酶
• PP2C
• 逆境胁迫

目的:基于全基因组策略系统解析药用植物丹参的蛋白磷酸酶2C家族成员,为研究丹参逆境胁迫响应的分子机制奠定基础。方法:采用BLASTP序列比对、系统发育树构建、基因表达分析等方法解析丹参PP2C亚家族成员、基因结构以及差异表达图谱。结果:丹参基因组共注释到83个PP2C家族成员,在高等植物中保守存在;系统进化分析将PP2C家族分为13个亚家族(PP2CA-PP2CL,A、B、C、D、E、F1、F2、G、H、I、J、K、L),结构域高度保守;PP2CA亚家族基因启动子含有多种逆境胁迫应答的顺式作用元件,大部分PP2CA基因表达显著响应逆境胁迫信号。结论:本实验系统研究丹参PP2C基因的结构、在不同组织部位的表达及逆境胁迫下的响应,为揭示丹参响应生物或非生物胁迫的分子机制研究提供理论依据。

• 单位
  国家中医药管理局; 中国医学科学院药用植物研究所