摘要
目的探索甲型流感的暴发规律及毒株血凝素(hemagglutinin,HA)基因的进化。方法通过分析中国采集并公布的甲型流感病毒基因数据,对中国大陆所有宿主为人、禽类和哺乳动物的HA基因氨基酸序列进行多序列比对,并用于构建HA的系统发育树,同时对中国香港地区的HA基因蛋白序列同样处理;分析不同宿主的HA基因的受选择压力。结果选择中国大陆1 252个HA基因和香港485个HA基因,对其分析发现,自2002年以来,禽流感的暴发次数和频率多于历史记录;系统发育树结果显示中国大陆和香港地的HA基因邻接树的拓扑结构一致;宿主为人的HA基因受选择大于禽类宿主的HA基因。结论不同宿主的HA基因受选择有差异,提示HA基因的快速进化可能会对人类健康产生潜在威胁。
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单位生物电子学国家重点实验室; 深圳华大生命科学研究院; 东南大学