草原短尾羊TBXT基因RACE克隆及胚胎各个时期表达量分析

作者:杨光; 霍雨佳; 智达夫; 苏红; 杨宏新; 窦傲蕾; 曹贵方*
来源:中国畜牧杂志, 2022, 58(04): 104-110.
DOI:10.19556/j.0258-7033.20210519-04

摘要

为鉴定草原短尾羊TBXT mRNA在胚胎发育中的表达趋势,分析其TBXT cDNA全长序列。本研究使用实时荧光定量PCR(Quantitative Real time PCR)方法对草原短尾羊14、16、20 d和25 d胚胎中TBXT mRNA相对表达量进行分析,之后使用RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)技术克隆TBXT cDNA全长。结果显示:TBXT mRNA在16 d胚胎中相对表达量最高,草原短尾羊TBXT cDNA全长为2 426 bp(GenBank登录号:MZ146381),其中开放阅读框(ORF)为1 335 bp,编码444个氨基酸,3’非编码区(3’UTR)和ployA尾长度为763 bp,5’非编码区(5’UTR)长度为328 bp;系统进化树显示草原短尾羊Brachyury与山羊进化关系最近,与羊驼关系最远,氨基酸同源性比对结果显示不同物种之间Brachyury同源性很高,表明在脊索动物进化过程中Brachyury功能相对保守。

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