基于RNA-Seq技术的向日葵油酸形成的转录组学分析

作者：于海峰; 韩平安; 李美娜; 陈阜^*; 郭树春; 李素萍; 张艳芳; 赵建军; 闫明霞

来源：中国油料作物学报, 2018, 40(06): 769-776.

• 向日葵
• 油酸
• RNA-Seq
• 形成机理

为探讨向日葵油酸调控机理,以高油酸材料J9和低油酸材料NK244为研究对象,在授粉后20d取材,采用RNA-Seq技术研究转录组。经比较分析,2个材料共鉴定到差异表达基因(DET)5 447个,其中上调表达基因2 709个,下调表达基因2 738个。对DET进行生物信息学分析,GO信息分析表明,有2 218个DET富集到57个功能条目,其中上调表达基因主要涉及催化活性、异构酶活性、碳水化合物结合、DNA结合、脂结合、碳水化合物过程、脂代谢过程和脂肪酸生物合成等;下调表达基因主要涉及蛋白激酶活性、ATP结合、蛋白磷酸化、tRNA氨酰化的蛋白质翻译和纤维素生物合成过程。KEGG分析中799个差异表达片段被显著富集在28个通路,主要为碳水化合物代谢通路和脂代谢通路。

• 单位
  中国农业大学; 内蒙古自治区农牧业科学院; 农业部