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摘要
为了为鹿茸生长发育机制及CDKN2C基因在鹿茸生长发育中所发挥的重要功能研究提供理论依据和技术支持,试验根据GenBank中公布的牛、绵羊的CDKN2C基因序列设计引物,采用PCR扩增和分子克隆技术,首次从梅花鹿鹿茸顶端组织中克隆出包含CDKN2C全部编码区的基因序列,利用生物信息学方法对该基因核苷酸序列以及编码氨基酸序列的结构特征进行初步预测分析,并基于该基因氨基酸序列构建了系统进化树。结果表明:梅花鹿CDKN2C基因CDS区全长507 bp,编码168个氨基酸,系统进化树结果显示其与大羚羊、野骆驼、牛以及马的亲缘关系较近,其编码蛋白质的相对分子质量为18 325.67,一级结构中亮氨酸和丙氨酸含量较多,分别占比14.3%和13.1%,为亲水非分泌性蛋白,无信号肽。结构域预测发现第46～127位氨基酸残基之间存在Ank2结构域。二级结构分析显示该蛋白α-螺旋占47.62%,延伸链占12.50%,自由卷曲占39.88%。三级结构预测显示其结构与牛更为相似。该蛋白含有2个丝氨酸和3个苏氨酸磷酸化位点,分别位于氨基酸序列的第23,154位和第88,126,139位,没有发现N-糖基化位点以及O-糖基化位点。
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