摘要
分析新疆2006-2020年甲型H3N2流感病毒血凝素(Hemagglutinin,HA)基因的遗传变异特征。选取新疆2006年10月-2020年3月分离的32株H3N2流感毒株,进行核酸提取、HA基因扩增和测序,用CExpress软件进行拼接,MEGA-X软件进行数据整理,beast软件构建系统进化树,用P-epitope模型评估疫苗的有效性。新疆2006-2020年检测阳性样本中H3N2亚型在2006-2007、2010-2011、2012-2013、2014-2015、2016-2017、2019-2020年占比分别为77.78%、57.16%、64.53%、80.48%、87.35%、74.56%。H3N2流感病毒优势流行株2011年前以为A/Brisbane/10/2007类似株分支和A/Perth/16/2009(group1)分支为主,2011年后以3C分支为主。系统进化树分析显示,同一监测年度的流行株基本呈现集中分布。分子特征显示与疫苗株A/California/7/2004相比HA蛋白共有55个氨基酸位点变异,其中HA1和HA2分别占45和9个,HA1氨基酸的变异位点中28个位于抗原决定簇,5个抗原决定簇均发生变异,受体结合位点在135、137、225发生变异;2013-2020年RBS左侧壁发生N225D回复突变,128、138、193位存在回复突变分别为T-A-T、S-A-S、S-F-S, 2014-2015年本地流行株与疫苗株A/Texas/50/2012相比A区、B区发生A138S、R142G、N145S、N128A、F159S突变,2015-2016年本地流行株与疫苗株A/Switzerland/9715293/2013相比A区、B区发生S138A、R140I、G142R、N144S、A128T、S159Y、K160T、V186G突变,2019-2020年本地流行株与疫苗株A/Kansas/14/2017相比A区、B区发生T135K、S137F、K144S、S159Y、K160T、N190D突变;糖基化位点自2006年10月-2020年3月变化增加,糖基化位点最多的集中在3C分支存在13个糖基化位点,3C分支均增加了45NSS糖基化位点,仅3C.2和3C.2a1分支存在158NYT且114NNS消失。新疆2006-2020年甲型H3N2流感病毒HA基因不断发生突变,出现了抗原漂移,部分流行株与当年推荐疫苗株匹配程度降低,流感网络实验室连续开展流感监测,有助于及早发现流感病毒的变异特征。
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单位新疆维吾尔自治区疾病预防控制中心