血清4型禽腺病毒广西分离株GX2019-010全基因组测序与分析

作者：栾勇娇; 谢芝勋^*; 王盛; 罗思思; 张蕾; 谢丽基; 谢志勤; 邓显文; 张民秀; 张艳芳; 曾婷婷; 范晴

来源：中国畜牧兽医, 2020, 47(12): 3793-3804.

DOI：10.16431/j.cnki.1671-7236.2020.12.001

• 血清4型禽腺病毒(FAdV-4)
• 全基因组测序
• 进化分析

为了解广西地区血清4型禽腺病毒(FAdV-4)的基因特征,本研究对实验室前期分离的一株FAdV-4(命名为GX2019-010)进行了全基因组测序,对所获核苷酸序列进行同源性比对和遗传进化分析,并进一步分析了主要结构蛋白Hexon、Penton和Fiber的氨基酸序列。结果显示,GX2019-010全长43 719 bp,GC含量为54.9%,主要包括43个潜在蛋白质编码区域。核苷酸序列同源性比对发现,GX2019-010与致病株MX-SHP95的同源性为95.8%,与非致病株ON1和KR5同源性分别为95.0%和95.2%。遗传进化分析显示,GX2019-010与中国FAdV-4近几年的流行毒株在同一分支,而与国外FAdV-4毒株不在同一分支,说明FAdV-4存在遗传差异,主要的差异存在于基因组的右端,国内分离株均出现1 966 bp的缺失,其中包括ORF19、ORF48和ORF27基因的缺失,说明中国流行的FAdV-4具有地域性。对主要结构蛋白Hexon、Penton和Fiber的氨基酸序列分析发现,3个主要结构蛋白均有氨基酸位点的突变,其中Fiber-2的突变位点最多。本研究丰富了广西地区FAdV-4的基因库,为今后心包积液-肝炎综合征(HHS)的防控及流行病学调查研究提供了参考依据。

• 单位
  广西壮族自治区兽医研究所; 广西大学