细胞衰老基因CDKN2B上调与甲状腺癌侵袭性及免疫细胞浸润的关系

作者：郑通; 肖志远; 汪丽丹^*

来源：中国老年学杂志, 2023, 43(19): 4659-4664.

• 细胞衰老
• 甲状腺癌
• CDKN2B
• 肿瘤免疫浸润

目的 分析生物信息学对细胞衰老相关基因(AGs)CDKN2B与甲状腺癌(TC)的侵袭性及免疫细胞浸润的关系。方法 从肿瘤基因组图谱(TCGA)得到衰老相关基因在TC组织和癌旁正常甲状腺组织中的转录表达谱进行差异分析。对表达上调的细胞周期蛋白依赖性激酶抑制因子(CDKN)2B进行基因层面表达分析及蛋白水平层面的免疫组化分析。采用受试者工作特征(ROC)曲线对TC组织与癌旁正常组织进行鉴别。在Mexpress数据库中评估THCA患者CDKN2B mRNA表达与THCA患者临床数据的关系。使用基因本体功能注释(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因集富集分析(GSEA)对差异表达基因进行功能及通路富集分析。通过肿瘤免疫评估资源(TIMER)和肿瘤-免疫系统相互作用数据库(TISIDB)确定CDKN2B mRNA的表达与免疫细胞浸润的关系。结果 TCGA数据库分析，与甲状腺癌旁组织相比，CDKN2B mRNA在TC组织中明显高表达，在癌旁组织明显低表达(P<0.05)。ROC曲线分析得出，在CDKN2B临界值为1.945时，其敏感性、特异性和准确性分别为96.58%、84.53%和85.74%。Mexpress数据库分析显示，CDKN2B mRNA的表达与组织学类型、M分期、N分期、个人肿瘤癌症状况、性别、肿瘤分期、总生存时间差异有统计学意义(P<0.05)。GO分析表明，这些差异基因与生长因子受体信号通路和细胞衰老信号通路相关。KEGG通路富集分析主要与细胞衰老和P53信号通路相关。TIMER数据库分析，TC组织中CDKN2B表达与中性粒细胞(r=0.526,,P<0.001)、CD4+T细胞(r=0.507,P<0.001)、树突细胞(r=0.437,P<0.001)、B细胞(r=0.356,P<0.001)、巨噬细胞呈正相关(r=0.335,P<0.001)。TISIDB数据库分析显示CDKN2B表达与Th1细胞、Th2细胞、中性粒细胞、未成熟树突细胞、巨噬细胞相关。免疫组化结果显示，甲状腺乳头癌(PTC)和癌旁组织中CDKN2B表达的阳性率差异显著(P<0.001)。PTC组织中CDKN2B的表达与肿瘤直径和淋巴结转移相关(P<0.05),与患者性别、年龄、腺外侵犯无关(P>0.05)。结论 CDKN2B在THCA中的高表达可能与肿瘤的侵袭和免疫浸润显著相关。

• 单位
  锦州医科大学