家兔肌肉组织中保守miRNA的鉴定及进化分析

作者：张翔宇; 张翠霞; 张凯; 袁定胜; 李钰莹; 邝良德; 李丛艳; 郑洁; 任永军; 郭志强; 唐丽; 季杨; 杨锐; 雷岷; 黄邓萍; 谢晓红; 杨超^*

来源：四川农业大学学报, 2023, 41(04): 713-718.

DOI：10.16036/j.issn.1000-2650.202302232

• 家兔
• Solexa测序
• 微小RNA
• 生物信息学方法

【目的】旨在鉴定家兔肌肉组织中的保守miRNA，获取其表达谱并分析其进化特征，进而为研究保守性miRNA在家兔生长发育过程中的生物学功能提供理论依据。【方法】采用Solexa技术对家兔背最长肌组织中miRNA进行了测序和分析。【结果】通过序列比对鉴定出521个保守的miRNA序列，分属于238个不同的家族。其中miR-1、miR-133、miR-206和miR-499等肌肉特异性表达的miRNA在肌肉中均有表达，且除miR-499外的其它3个miRNA在所测定样本中均高表达。10个动物保守性miRNA家族在S86专门化父系肌肉基因组中出现了丢失。靶基因显著富集于13条信号通路，其中Focal adhesion和PI3K-Akt信号通路与肌肉发育密切相关。【结论】研究鉴定的影响肌肉发育的miRNA及其靶基因富集通路，将有助于家兔生长调控机制的研究，加快可用于标记辅助选择的分子标记的开发。

• 单位
  四川省草原科学研究院; 四川省畜牧科学研究院