细粒棘球绦虫AgB1抗原表位的生物信息学预测

作者：马秀敏; 胡晓安; 阿尔孜古丽·吐尔逊; 李艳华; 刘学磊; 朱明; 丁剑冰

来源：科技导报, 2013, (27): 27-30.

• AgB1
• B细胞表位
• T细胞表位
• 生物信息学 AgB1
• B cell epitopes
• T cell epitopes
• bioinformatics

以细粒棘球绦虫AgB1基因序列为基础,采用PredictProtein软件预测其编码蛋白的二级结构;应用在线预测软件Bcepred、Abcpred、IEDB及SYFPEITHI等对细粒棘球绦虫AgB1的B细胞表位和T细胞表位进行预测。结果提示,AgB1抗原蛋白存在可以构成抗原表位的区域,经软件分析,分值高的B细胞表位区域:2~9、15~20、22~35和41~52氨基酸序列;T细胞表位区域:3~12、26~33、34~44和52~61氨基酸序列。研究运用生物信息学确定AgB1抗原的4个B细胞优势表位和4个T细胞优势表位,对进一步研究AgB1的抗原性和研发更有价值的免疫诊断方法具有重要意义。

• 单位
  新疆医科大学第一附属医院; 新疆医科大学