细菌演化研究在测序技术的支持下获得了大量成果。研究范围从代表性种类向其他种类持续扩大,研究层次从单一序列迅速推进至整个基因组。本文以细菌演化的研究对象、研究发现和研究工具为线索,较详细地介绍了近些年来细菌演化研究及所用工具所取得的各项成果。这些成果对揭示生物演化本质、促进分析技术发展、服务生产生活和医疗卫生都有重要意义。