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摘要
基因芯片是一种通过DNA双链或DNA-RNA互补杂交检测特定DNA序列的高通量技术，其中SNP基因分型芯片已经广泛用于畜禽的遗传育种工作，在牛(Bos taurus)、猪(Sus scrofa)、羊(Caprinae)、鸡(Gallus gallus)等畜禽中取得了重大成就。但是在实际生产中使用的基因组选择仅利用了基因组信息，无法完全解释复杂性状的分子遗传基础，限制了基因组选择的准确性。随着表观遗传学研究的不断深入、商用甲基化芯片的推出、表观基因组关联分析(epigenome-wide association study,EWAS)的提出，DNA甲基化已被广泛用于解释遗传与表型的因果关系。未来，有望开发专门针对畜禽的甲基化芯片，通过EWAS探索与畜禽经济性状显著相关的甲基化位点，深化对复杂性状因果变异的理解。结合甲基化芯片与SNP芯片捕获畜禽表观基因组和基因组信息，更准确地解读遗传变异，提高基因组选择的准确性，推动畜禽分子遗传育种工作的精细化发展。本文综述了SNP芯片在畜禽上的应用，并对甲基化芯片在畜禽上的应用进行了展望，以期为基因芯片在动物育种中的进一步应用提供借鉴和参考。
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