人呼吸道合胞病毒感染的A549细胞中长链非编码RNA表达谱研究

作者：刘美琴; 高博; 焦月盈; 李玮; 虞结梅; 彭向雷; 郑妍鹏; 付远辉; 何金生^*

来源：中国生物工程杂志, 2021, 41(Z1): 7-13.

DOI：10.13523/j.cb.2009002

• 人呼吸道合胞体病毒
• A549细胞
• 长链非编码RNA
• 表达谱

目的:探讨人呼吸道合胞体病毒(human respiratory syncytial virus,RSV)感染A549细胞的长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNA)表达谱的差异,更好地了解宿主与RSV之间的相互作用的可能分子机制。方法:1 MOI RSV感染A549细胞,24h后提取RNA,利用Agilent的lncRNA表达谱芯片,筛查了RSV感染和未感染的A549细胞中的lncRNA差异表达谱,并进行实时定量PCR验证,通过GO和KEGG对差异mRNA和lncRNA进行生物信息学分析。结果:RSV感染的A549细胞与未感染的A549细胞相比,共有1 463个lncRNA和1 552个mRNAs显著上调,有944个lncRNA和1 489个mRNAs下调,差异表达lncRNA及其预测靶基因主要富集于免疫应答过程。通过定量PCR证实所选lncRNA的表达谱结果。结论:RSV感染A549细胞后,lncRNA表达谱发生明显变化,对深入研究lncRNA如何参与RSV与宿主之间的相互作用奠定了基础。

• 单位
  北京交通大学