脂多糖结合蛋白在胃癌组织中的表达及其意义的生物信息学分析

作者：任晨霞; 武翠玲^*; 韩鹏勇

来源：中国免疫学杂志, 2021, 37(10): 1201-1209.

• 胃癌
• 脂多糖结合蛋白
• 生物信息学分析
• 共表达分析

目的:通过生物信息学方法分析脂多糖结合蛋白(LBP)在胃癌组织中的表达及意义。方法:从Ualcan数据库获取正常胃组织及胃癌组织LBP表达数据,利用GEPIA数据库分析LBP表达与胃癌患者预后的关系,在LinkedOmics中检索LBP在胃癌中的共表达基因,通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因参与的生物学过程及功能。最后利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络。结果:与正常胃组织相比,Ⅰ和Ⅲ分期、老年和男性患者胃癌组织中LBP表达水平均明显升高,但与幽门螺杆菌感染与否无显著相关性。在胃癌中与LBP共表达的基因主要涉及急性炎症反应、激活蛋白级联、蛋白质-脂质复合物亚基组织等生物学过程,介导货物受体活性、脂多糖结合、蛋白质-脂质复合物的绑定、糖胺聚糖绑定等分子功能,富集于血液微粒、蛋白质-脂质复合物、内质网腔等细胞组分。富集的KEGG信号通路主要与补体和凝血级联、胆固醇代谢、PPAR信号等通路相关。LBP高表达患者的总生存率和无病生存率明显低于LBP低表达患者。LBP蛋白与TLR4、STAT3、IL-6、STAT6、IL-4、IL-10、JAK1、JAK2、JAK3、SOCS3等存在互作关系。结论:LBP在胃癌组织中高表达,且与胃癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为胃癌筛选、预后预测的标志物之一。

• 单位
  中心实验室; 长治医学院