医院相关性ST5型耐甲氧西林金黄色葡萄球菌ZJ5499的全基因测序及序列分析

作者：周佳维; 李昂; 蒋琰; 华孝挺; 俞云松

来源：中国微生态学杂志, 2016, 28(10): 1138-1142.

DOI：10.13381/j.cnki.cjm.201610006

• 耐甲氧西林金黄色葡萄球菌
• 院内感染
• 全基因组测序
• 毒力因子
• 耐药基因 Methicillin-resistant Staphylococcus aureus
• Hospital-acquired infection
• Whole-genome sequencing
• Virulence factor
• Antibiotic resistant gene

目的对1例医院获得性耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)肺炎患者血中分离的1株MRSA(ZJ5499)进行基因组序列信息解析。方法采用Illumina平台高通量测序和Sanger测序相结合对ZJ5499菌株进行全基因组测序,并使用相关软件对序列进行拼接、基因预测、功能注释、直系同源簇注释(COG)及毒力因子和耐药基因分析;并与国内常见流行序列型(ST型)菌株进行进化关系分析、毒力因子和耐药基因比较。结果 ZJ5499菌株基因组大小为2 888 783bp,GC含量32.84%,序列已提交至GenBank数据库,登录号为CP011685。该菌株基因组中含有大量与致病性相关的毒力因子,并含有spc...

• 单位
  浙江大学医学院附属邵逸夫医院; 传染病诊治国家重点实验室; 浙江大学医学院附属第一医院