黏液型与非黏液型铜绿假单胞菌的比较蛋白组学分析

作者：罗文英; 刘建军; 丁瑜; 杨拉维; 任晓虎

来源：第三军医大学学报, 2017, 39(13): 1345-1351.

DOI：10.16016/j.1000-5404.201701023

• 黏液型
• 铜绿假单胞菌
• 生物标志物
• 蛋白质组学

目的探讨黏液型与非黏液型铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,P.a)的差异蛋白谱,以发现黏液型P.a潜在的生物标志物。方法采用来自于临床囊性纤维化患者分离的3株黏液型P.a菌株,脉冲场凝胶电泳以确定它们的同源性;采用同位素相对和绝对定量标记(isobaric tags for relative and absolute quantitation,i TRAQ)结合二维液相色谱串联质谱(two-dimensional liquid chromatography-tandem mass spectrometry,2D LC-MS/MS)技术分析3株黏液型与对照组1株非黏液型P.a的差异蛋白谱,并采用RT-q PCR方法对5个共同差异蛋白进行验证。结果 3株黏液型P.a菌株不具有同源性,i TRAQ结果没有明显差异。3组共有219个上调和101个下调差异蛋白。pa2815、pa2018、dnak、pa5046和acef基因转录水平与i TRAQ结果一致。结论不同黏液表型P.a的i TRAQ结果没有明显差异,219个上调和101个下调差异蛋白可以作为研究黏液型与非黏液型P.a致病机制的候选生物标志物。

• 单位
  广东医科大学附属医院; 深圳市疾病预防控制中心